La provincia de Cuenca se encuentra entre las zonas con menor impacto sanitario de la contaminación atmosférica en España, de acuerdo con un informe publicado por Ecologistas en Acción y financiado por el Ministerio para la Transición Ecológica y el Reto Demográfico. Este estudio revela que Cuenca presenta 46 muertes por cada 100.000 habitantes asociadas a la contaminación, cifra que se sitúa por debajo de la media nacional de 73 muertes.
Las muertes en Cuenca atribuidas a la contaminación del aire se desglosan en 36 por partículas PM2,5, dos por dióxido de nitrógeno (NO2) y 28 por ozono troposférico. Este bajo rendimiento se traduce en una proporción del 2,8% de muertes atribuibles a la contaminación, frente al 5,8% que se observa en el conjunto del Estado español. Además, durante el año 2025, las mediciones en la estación de Cuenca no sobrepasaron el umbral recomendado de 120 microgramos/m3 por la OMS.