En 2025, la Consejería de Transición Ecológica de Canarias reportó una ejecución presupuestaria del 42,26%, la cifra más baja entre el resto de consejerías del Gobierno de Canarias. A pesar de contar con un crédito ajustado de 497,6 millones de euros, solo se reconocieron obligaciones por 210,3 millones. La Consejería, dirigida por Mariano Zapata, argumenta que este bajo porcentaje se debe principalmente al proceso contable relacionado con los fondos europeos Next Generation, que no se reflejan en las cuentas hasta que se complete la justificación administrativa.

La Consejería asegura que más de 323 millones de euros han sido concedidos y que hay muchos proyectos adjudicados o en ejecución que aún no se contabilizan como obligaciones reconocidas. Además, identifican factores como la burocracia compleja, la falta de personal en empresas instaladoras, problemas en la cadena de suministro y circunstancias meteorológicas como causas que han ralentizado la certificación de proyectos. Si se excluyeran los fondos europeos, la ejecución de programas ordinarios alcanzaría aproximadamente el 94%. Por el contrario, el Gobierno de Canarias en general ejecutó el 93,83% de su presupuesto en 2025.